Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SFTPDP35247 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms