Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RCVRNP35243 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RCVRNP35243 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms