Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms