Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
ABCC1P33527 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ABCC1P33527 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms