Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	PEP5	YMR231W	3090 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	DSE1	YER124C	1722 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	BUD6	YLR319C	2367 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YSH1	YLR277C	2340 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	QRI7	YDL104C	1224 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	HNT2	YDR305C	654 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	SLX8	YER116C	825 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	BNA1	YJR025C	534 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	FOL3	YMR113W	1284 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YPT53	YNL093W	663 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YOR318C	YOR318C	306 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	PIN3	YPR154W	648 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	VHS3	YOR054C	2025 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	TAF5	YBR198C	2397 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YER158C	YER158C	1722 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	NMD3	YHR170W	1557 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	MET4	YNL103W	2019 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	PDS1	YDR113C	1122 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	PRO3	YER023W	861 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	SPI1	YER150W	447 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	RPS25A	YGR027C	327 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	THP2	YHR167W	786 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	AIM19	YIL087C	474 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	RPS30A	YLR287C-A	192 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	SUR1	YPL057C	1149 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YPR078C	YPR078C	1119 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	AKL1	YBR059C	3327 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	RNA14	YMR061W	2034 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	MTH1	YDR277C	1302 nt		3.96	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	SUP35	YDR172W	2058 nt		3.96	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	TPD3	YAL016W	1908 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	PRP11	YDL043C	801 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YDR203W	YDR203W	318 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RGI1	YER067W	486 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	MLC1	YGL106W	450 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YIP5	YGL161C	933 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	SUT1	YGL162W	900 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	COX4	YGL187C	468 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YGL188C	YGL188C	174 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YOL075C	YOL075C	3885 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	THI21	YPL258C	1656 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	CYM1	YDR430C	2970 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	URK1	YNR012W	1506 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	DSS1	YMR287C	2910 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	HO	YDL227C	1761 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RCR2	YDR003W	633 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	ATC1	YDR184C	885 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	FCF1	YDR339C	570 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	APA2	YDR530C	978 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	IRC22	YEL001C	678 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YER076C	YER076C	909 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YGL132W	YGL132W	336 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YGR182C	YGR182C	354 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	MMF1	YIL051C	438 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	CCE1	YKL011C	1062 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	SLZ1	YNL196C	897 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	TRM10	YOL093W	882 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RPS10A	YOR293W	318 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	SAM4	YPL273W	978 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	HPA2	YPR193C	471 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	POP7	YBR167C	423 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	MTR10	YOR160W	2919 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	URC2	YDR520C	2319 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	SPH1	YLR313C	1593 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YDR545C-A	YDR545C-A	480 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YEL077W-A	YEL077W-A	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	FAU1	YER183C	636 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YER190C-B	YER190C-B	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YFL068W	YFL068W	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	RPL24A	YGL031C	468 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YGR296C-B	YGR296C-B	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YHL050W-A	YHL050W-A	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YHR219C-A	YHR219C-A	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YIL177W-A	YIL177W-A	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	DAL3	YIR032C	588 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YJL225W-A	YJL225W-A	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YPT52	YKR014C	705 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YLL066W-A	YLL066W-A	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YLL067W-A	YLL067W-A	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YLR466C-A	YLR466C-A	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YLR467C-A	YLR467C-A	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YML133W-B	YML133W-B	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	NRK1	YNL129W	723 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YNL339W-B	YNL339W-B	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YGK3	YOL128C	1128 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YBL113W-A	YBL113W-A	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YOR379C	YOR379C	339 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YOR396C-A	YOR396C-A	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YPL283W-B	YPL283W-B	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YPR204C-A	YPR204C-A	483 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	MUD1	YBR119W	897 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YCL007C	YCL007C	393 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YGL036W	YGL036W	2730 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	REF2	YDR195W	1602 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	VID28	YIL017C	2766 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	YOR365C	YOR365C	2112 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	IMD2	YHR216W	1572 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	ATM1	YMR301C	2073 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SIP1	P32578	HOS3	YPL116W	2094 nt		3.93	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.4 ms