Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDI1P31150 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GDI1P31150 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDI1P31150 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDI1P31150 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDI1P31150 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDI1P31150 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GDI1P31150 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDI1P31150 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDI1P31150 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDI1P31150 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDI1P31150 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDI1P31150 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDI1P31150 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDI1P31150 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDI1P31150 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDI1P31150 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDI1P31150 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GDI1P31150 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDI1P31150 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDI1P31150 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDI1P31150 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDI1P31150 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDI1P31150 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDI1P31150 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDI1P31150 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDI1P31150 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDI1P31150 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDI1P31150 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDI1P31150 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDI1P31150 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDI1P31150 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDI1P31150 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDI1P31150 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDI1P31150 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDI1P31150 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDI1P31150 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDI1P31150 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDI1P31150 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDI1P31150 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDI1P31150 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDI1P31150 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDI1P31150 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDI1P31150 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDI1P31150 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDI1P31150 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDI1P31150 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDI1P31150 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDI1P31150 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDI1P31150 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDI1P31150 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDI1P31150 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDI1P31150 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDI1P31150 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDI1P31150 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDI1P31150 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDI1P31150 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDI1P31150 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDI1P31150 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDI1P31150 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms