Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGA1P29973 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGA1P29973 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms