Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCKSP29966 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCKSP29966 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms