Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD40LGP29965 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD40LGP29965 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms