Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINB3P29508 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINB3P29508 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms