Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPRMP28827 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
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