Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCAP28676 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCAP28676 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCAP28676 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCAP28676 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCAP28676 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCAP28676 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCAP28676 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCAP28676 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCAP28676 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCAP28676 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCAP28676 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCAP28676 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCAP28676 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCAP28676 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCAP28676 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCAP28676 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCAP28676 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCAP28676 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCAP28676 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCAP28676 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCAP28676 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCAP28676 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCAP28676 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCAP28676 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCAP28676 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCAP28676 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCAP28676 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCAP28676 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCAP28676 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCAP28676 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCAP28676 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCAP28676 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCAP28676 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCAP28676 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCAP28676 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCAP28676 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCAP28676 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCAP28676 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCAP28676 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCAP28676 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCAP28676 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCAP28676 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCAP28676 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCAP28676 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCAP28676 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCAP28676 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCAP28676 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCAP28676 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCAP28676 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCAP28676 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCAP28676 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCAP28676 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCAP28676 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCAP28676 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCAP28676 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCAP28676 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCAP28676 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCAP28676 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCAP28676 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCAP28676 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCAP28676 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCAP28676 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCAP28676 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCAP28676 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCAP28676 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCAP28676 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCAP28676 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCAP28676 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCAP28676 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCAP28676 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCAP28676 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCAP28676 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms