Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HLA-DMAP28067 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DMAP28067 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms