Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMLP26374 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMLP26374 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMLP26374 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMLP26374 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMLP26374 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMLP26374 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMLP26374 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMLP26374 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMLP26374 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMLP26374 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMLP26374 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMLP26374 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMLP26374 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMLP26374 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMLP26374 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMLP26374 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMLP26374 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMLP26374 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMLP26374 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMLP26374 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMLP26374 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMLP26374 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMLP26374 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMLP26374 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMLP26374 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMLP26374 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMLP26374 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMLP26374 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMLP26374 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMLP26374 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMLP26374 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMLP26374 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMLP26374 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMLP26374 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMLP26374 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMLP26374 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMLP26374 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMLP26374 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMLP26374 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMLP26374 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMLP26374 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMLP26374 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMLP26374 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMLP26374 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMLP26374 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMLP26374 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMLP26374 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMLP26374 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMLP26374 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMLP26374 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMLP26374 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMLP26374 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMLP26374 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMLP26374 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMLP26374 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMLP26374 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMLP26374 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMLP26374 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMLP26374 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMLP26374 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMLP26374 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMLP26374 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMLP26374 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMLP26374 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMLP26374 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMLP26374 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMLP26374 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMLP26374 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms