Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNE1P24864 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms