Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDELR1P24390 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELR1P24390 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms