Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP100P23497 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP100P23497 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP100P23497 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP100P23497 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP100P23497 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP100P23497 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SP100P23497 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SP100P23497 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP100P23497 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP100P23497 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP100P23497 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP100P23497 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP100P23497 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP100P23497 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP100P23497 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP100P23497 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP100P23497 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP100P23497 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP100P23497 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP100P23497 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP100P23497 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP100P23497 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP100P23497 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP100P23497 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP100P23497 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms