Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCSHP23434 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCSHP23434 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCSHP23434 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCSHP23434 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCSHP23434 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCSHP23434 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCSHP23434 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCSHP23434 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCSHP23434 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCSHP23434 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCSHP23434 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCSHP23434 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCSHP23434 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCSHP23434 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCSHP23434 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCSHP23434 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCSHP23434 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCSHP23434 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCSHP23434 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCSHP23434 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCSHP23434 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCSHP23434 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCSHP23434 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms