Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNA5P22460 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA5P22460 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms