Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGB6P18564 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB6P18564 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms