Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC2P18074 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC2P18074 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms