Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPI1P17947 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPI1P17947 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPI1P17947 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPI1P17947 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPI1P17947 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPI1P17947 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPI1P17947 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPI1P17947 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPI1P17947 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPI1P17947 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPI1P17947 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPI1P17947 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPI1P17947 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPI1P17947 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPI1P17947 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPI1P17947 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPI1P17947 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPI1P17947 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPI1P17947 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPI1P17947 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPI1P17947 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPI1P17947 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPI1P17947 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPI1P17947 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPI1P17947 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPI1P17947 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPI1P17947 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPI1P17947 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms