Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZSCAN20P17040 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSCAN20P17040 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms