Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB3P16520 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB3P16520 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB3P16520 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB3P16520 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GNB3P16520 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GNB3P16520 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB3P16520 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB3P16520 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB3P16520 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB3P16520 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB3P16520 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB3P16520 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB3P16520 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB3P16520 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB3P16520 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB3P16520 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB3P16520 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GNB3P16520 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GNB3P16520 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GNB3P16520 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GNB3P16520 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GNB3P16520 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GNB3P16520 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GNB3P16520 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GNB3P16520 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms