Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRAP16234 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms