Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRA1P14867 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRA1P14867 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms