Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARGP13631 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARGP13631 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARGP13631 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARGP13631 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARGP13631 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARGP13631 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARGP13631 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARGP13631 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARGP13631 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARGP13631 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARGP13631 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARGP13631 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARGP13631 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARGP13631 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARGP13631 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARGP13631 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARGP13631 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARGP13631 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARGP13631 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARGP13631 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARGP13631 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARGP13631 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARGP13631 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARGP13631 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARGP13631 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARGP13631 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARGP13631 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARGP13631 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARGP13631 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARGP13631 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RARGP13631 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARGP13631 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARGP13631 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms