Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD8P13378 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms