Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms