Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODC1P11926 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODC1P11926 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODC1P11926 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ODC1P11926 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODC1P11926 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODC1P11926 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODC1P11926 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ODC1P11926 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODC1P11926 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODC1P11926 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ODC1P11926 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ODC1P11926 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ODC1P11926 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ODC1P11926 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ODC1P11926 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ODC1P11926 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ODC1P11926 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ODC1P11926 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODC1P11926 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODC1P11926 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODC1P11926 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODC1P11926 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODC1P11926 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODC1P11926 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODC1P11926 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODC1P11926 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODC1P11926 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODC1P11926 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODC1P11926 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODC1P11926 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODC1P11926 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODC1P11926 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ODC1P11926 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODC1P11926 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODC1P11926 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODC1P11926 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODC1P11926 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODC1P11926 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODC1P11926 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODC1P11926 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODC1P11926 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODC1P11926 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODC1P11926 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODC1P11926 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ODC1P11926 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODC1P11926 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODC1P11926 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODC1P11926 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODC1P11926 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms