Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MS4A1P11836 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms