Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COX5BP10606 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COX5BP10606 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COX5BP10606 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COX5BP10606 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COX5BP10606 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COX5BP10606 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COX5BP10606 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COX5BP10606 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COX5BP10606 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COX5BP10606 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COX5BP10606 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COX5BP10606 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COX5BP10606 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COX5BP10606 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COX5BP10606 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COX5BP10606 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COX5BP10606 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COX5BP10606 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COX5BP10606 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COX5BP10606 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COX5BP10606 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COX5BP10606 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COX5BP10606 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COX5BP10606 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COX5BP10606 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COX5BP10606 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COX5BP10606 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COX5BP10606 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COX5BP10606 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COX5BP10606 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COX5BP10606 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COX5BP10606 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COX5BP10606 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms