Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARAP10276 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARAP10276 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARAP10276 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARAP10276 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARAP10276 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARAP10276 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARAP10276 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARAP10276 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARAP10276 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARAP10276 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARAP10276 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RARAP10276 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RARAP10276 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARAP10276 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARAP10276 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARAP10276 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARAP10276 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARAP10276 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RARAP10276 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARAP10276 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARAP10276 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARAP10276 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARAP10276 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARAP10276 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARAP10276 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARAP10276 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARAP10276 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARAP10276 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARAP10276 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARAP10276 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARAP10276 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms