Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C8orf88P0DMB2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C8orf88P0DMB2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms