Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms