Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2BP0DI82 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2BP0DI82 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2BP0DI82 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2BP0DI82 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2BP0DI82 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAPPC2BP0DI82 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC2BP0DI82 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC2BP0DI82 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC2BP0DI82 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAPPC2BP0DI82 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2BP0DI82 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms