Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms