Protein–RNA interactions for Protein: P08572

COL4A2, Collagen alpha-2(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A2P08572 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A2P08572 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A2P08572 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms