Protein–RNA interactions for Protein: P07864

LDHC, L-lactate dehydrogenase C chain, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHCP07864 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHCP07864 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHCP07864 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHCP07864 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHCP07864 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHCP07864 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDHCP07864 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDHCP07864 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDHCP07864 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDHCP07864 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDHCP07864 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDHCP07864 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDHCP07864 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDHCP07864 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LDHCP07864 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDHCP07864 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LDHCP07864 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHCP07864 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHCP07864 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHCP07864 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHCP07864 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHCP07864 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHCP07864 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHCP07864 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHCP07864 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDHCP07864 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDHCP07864 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDHCP07864 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDHCP07864 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDHCP07864 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDHCP07864 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDHCP07864 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHCP07864 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHCP07864 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHCP07864 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHCP07864 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHCP07864 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHCP07864 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHCP07864 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHCP07864 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHCP07864 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHCP07864 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHCP07864 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDHCP07864 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDHCP07864 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDHCP07864 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDHCP07864 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDHCP07864 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDHCP07864 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDHCP07864 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDHCP07864 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LDHCP07864 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LDHCP07864 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LDHCP07864 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDHCP07864 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDHCP07864 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDHCP07864 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDHCP07864 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDHCP07864 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms