Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFMP07197 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFMP07197 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFMP07197 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFMP07197 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFMP07197 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFMP07197 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFMP07197 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFMP07197 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFMP07197 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFMP07197 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFMP07197 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFMP07197 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFMP07197 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFMP07197 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFMP07197 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFMP07197 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFMP07197 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFMP07197 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFMP07197 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFMP07197 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFMP07197 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFMP07197 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFMP07197 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFMP07197 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFMP07197 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEFMP07197 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
NEFMP07197 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEFMP07197 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEFMP07197 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEFMP07197 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEFMP07197 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEFMP07197 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEFMP07197 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEFMP07197 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEFMP07197 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFMP07197 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFMP07197 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFMP07197 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFMP07197 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFMP07197 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFMP07197 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFMP07197 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFMP07197 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFMP07197 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFMP07197 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFMP07197 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFMP07197 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFMP07197 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEFMP07197 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms