Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IFNA4P05014 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms