Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A1BGP04217 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
A1BGP04217 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A1BGP04217 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A1BGP04217 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A1BGP04217 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1BGP04217 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1BGP04217 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1BGP04217 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1BGP04217 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1BGP04217 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A1BGP04217 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A1BGP04217 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A1BGP04217 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A1BGP04217 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A1BGP04217 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
A1BGP04217 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A1BGP04217 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A1BGP04217 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A1BGP04217 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A1BGP04217 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1BGP04217 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1BGP04217 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1BGP04217 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1BGP04217 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1BGP04217 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1BGP04217 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1BGP04217 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1BGP04217 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1BGP04217 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1BGP04217 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A1BGP04217 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1BGP04217 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1BGP04217 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1BGP04217 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1BGP04217 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1BGP04217 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
A1BGP04217 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1BGP04217 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1BGP04217 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1BGP04217 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1BGP04217 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A1BGP04217 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1BGP04217 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1BGP04217 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1BGP04217 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1BGP04217 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1BGP04217 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1BGP04217 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1BGP04217 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1BGP04217 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A1BGP04217 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
A1BGP04217 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A1BGP04217 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A1BGP04217 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A1BGP04217 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A1BGP04217 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.57■■■□□ 2
A1BGP04217 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
A1BGP04217 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A1BGP04217 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A1BGP04217 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A1BGP04217 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A1BGP04217 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A1BGP04217 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A1BGP04217 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.56■■■□□ 2
A1BGP04217 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A1BGP04217 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A1BGP04217 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A1BGP04217 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A1BGP04217 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A1BGP04217 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A1BGP04217 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A1BGP04217 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A1BGP04217 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
A1BGP04217 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A1BGP04217 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
A1BGP04217 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
A1BGP04217 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
A1BGP04217 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A1BGP04217 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A1BGP04217 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A1BGP04217 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.54■■■□□ 2
A1BGP04217 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
A1BGP04217 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
A1BGP04217 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A1BGP04217 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
A1BGP04217 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
A1BGP04217 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.54■■■□□ 2
A1BGP04217 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A1BGP04217 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A1BGP04217 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
A1BGP04217 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A1BGP04217 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A1BGP04217 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
A1BGP04217 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
A1BGP04217 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
A1BGP04217 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A1BGP04217 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A1BGP04217 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms