Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOEP02649 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOEP02649 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOEP02649 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOEP02649 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOEP02649 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOEP02649 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOEP02649 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOEP02649 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOEP02649 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOEP02649 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOEP02649 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOEP02649 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOEP02649 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOEP02649 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOEP02649 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOEP02649 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOEP02649 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOEP02649 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOEP02649 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOEP02649 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOEP02649 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOEP02649 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOEP02649 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOEP02649 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOEP02649 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOEP02649 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOEP02649 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOEP02649 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOEP02649 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOEP02649 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOEP02649 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOEP02649 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOEP02649 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOEP02649 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOEP02649 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms