Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EGFRP00533 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EGFRP00533 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EGFRP00533 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EGFRP00533 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EGFRP00533 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EGFRP00533 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EGFRP00533 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EGFRP00533 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EGFRP00533 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EGFRP00533 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EGFRP00533 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EGFRP00533 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EGFRP00533 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EGFRP00533 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EGFRP00533 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EGFRP00533 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EGFRP00533 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EGFRP00533 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EGFRP00533 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EGFRP00533 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EGFRP00533 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EGFRP00533 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EGFRP00533 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EGFRP00533 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EGFRP00533 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EGFRP00533 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EGFRP00533 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EGFRP00533 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EGFRP00533 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EGFRP00533 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EGFRP00533 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EGFRP00533 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EGFRP00533 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EGFRP00533 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EGFRP00533 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EGFRP00533 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EGFRP00533 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EGFRP00533 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EGFRP00533 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EGFRP00533 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EGFRP00533 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EGFRP00533 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EGFRP00533 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EGFRP00533 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EGFRP00533 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EGFRP00533 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EGFRP00533 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EGFRP00533 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EGFRP00533 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EGFRP00533 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EGFRP00533 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EGFRP00533 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EGFRP00533 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EGFRP00533 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EGFRP00533 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EGFRP00533 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EGFRP00533 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms