Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK4O96013 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAK4O96013 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK4O96013 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK4O96013 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK4O96013 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK4O96013 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK4O96013 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK4O96013 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK4O96013 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK4O96013 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK4O96013 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAK4O96013 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAK4O96013 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAK4O96013 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAK4O96013 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PAK4O96013 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK4O96013 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK4O96013 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK4O96013 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK4O96013 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK4O96013 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK4O96013 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK4O96013 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK4O96013 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAK4O96013 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAK4O96013 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAK4O96013 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK4O96013 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK4O96013 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK4O96013 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK4O96013 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK4O96013 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAK4O96013 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms