Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3O95983 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3O95983 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3O95983 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3O95983 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3O95983 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3O95983 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3O95983 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD3O95983 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MBD3O95983 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MBD3O95983 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MBD3O95983 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MBD3O95983 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD3O95983 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD3O95983 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD3O95983 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD3O95983 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD3O95983 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD3O95983 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD3O95983 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD3O95983 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD3O95983 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD3O95983 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD3O95983 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD3O95983 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD3O95983 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD3O95983 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD3O95983 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD3O95983 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD3O95983 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD3O95983 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD3O95983 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD3O95983 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms