Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBX7O95931 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX7O95931 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX7O95931 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX7O95931 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX7O95931 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX7O95931 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX7O95931 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX7O95931 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX7O95931 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX7O95931 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX7O95931 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX7O95931 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX7O95931 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX7O95931 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX7O95931 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX7O95931 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX7O95931 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX7O95931 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX7O95931 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX7O95931 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBX7O95931 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBX7O95931 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBX7O95931 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX7O95931 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX7O95931 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX7O95931 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX7O95931 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX7O95931 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX7O95931 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX7O95931 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX7O95931 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX7O95931 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX7O95931 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX7O95931 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX7O95931 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX7O95931 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX7O95931 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX7O95931 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms