Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX58O95786 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX58O95786 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX58O95786 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX58O95786 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX58O95786 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX58O95786 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX58O95786 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX58O95786 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX58O95786 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX58O95786 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX58O95786 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX58O95786 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX58O95786 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX58O95786 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX58O95786 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX58O95786 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX58O95786 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX58O95786 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX58O95786 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX58O95786 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX58O95786 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX58O95786 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX58O95786 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX58O95786 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX58O95786 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX58O95786 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX58O95786 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX58O95786 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX58O95786 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX58O95786 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX58O95786 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX58O95786 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX58O95786 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX58O95786 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX58O95786 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX58O95786 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX58O95786 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX58O95786 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX58O95786 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX58O95786 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX58O95786 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX58O95786 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX58O95786 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX58O95786 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX58O95786 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX58O95786 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX58O95786 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX58O95786 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX58O95786 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX58O95786 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX58O95786 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX58O95786 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX58O95786 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX58O95786 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX58O95786 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms