Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP29O95721 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAP29O95721 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms