Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC24BO95487 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24BO95487 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms